Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms