Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NIFKQ9BYG3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIFKQ9BYG3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms