Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FANCD2Q9BXW9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FANCD2Q9BXW9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FANCD2Q9BXW9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms