Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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