Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF4Q9BXJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF4Q9BXJ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms