Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SALL3Q9BXA9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SALL3Q9BXA9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms