Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRIP1Q9BX63 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRIP1Q9BX63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms