Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THUMPD2Q9BTF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms