Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM42Q9BTD8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms