Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LARP6Q9BRS8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LARP6Q9BRS8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms