Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
USB1Q9BQ65 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USB1Q9BQ65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms