Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms