Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SEMA3CQ99985 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms