Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL13Q99616 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms