Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POP1Q99575 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POP1Q99575 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms