Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PHF12Q96QT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms