Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARXQ96QS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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