Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRNT1Q96Q11 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms