Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNGAP1Q96PV0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms