Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRERF1Q96PN7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRERF1Q96PN7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms