Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF396Q96N95 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF396Q96N95 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms