Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPNS2Q96L46 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPNS2Q96L46 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms