Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms