Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDHR1Q96JP9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDHR1Q96JP9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms