Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC12Q96J65 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC12Q96J65 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms