Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED3Q96IU2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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