Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BCANQ96GW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
BCANQ96GW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms