Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EDC3Q96F86 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms