Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC97Q96F63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms