Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCC1Q96CN9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms