Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC35C1Q96A29 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC35C1Q96A29 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms