Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPS3Q969F9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPS3Q969F9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms