Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNRQ92752 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNRQ92752 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNRQ92752 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNRQ92752 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNRQ92752 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TNRQ92752 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNRQ92752 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNRQ92752 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNRQ92752 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms