Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNKSR2Q8WXI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNKSR2Q8WXI2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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