Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOBEC4Q8WW27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms