Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCAF4Q8WV16 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms