Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HELQQ8TDG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms