Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBA3Q8TBC4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBA3Q8TBC4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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