Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45GIP1Q8TAE8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms