Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD1Q8NHV4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEDD1Q8NHV4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms