Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CADM4Q8NFZ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CADM4Q8NFZ8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms