Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG2Q8N3U4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms