Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SVBPQ8N300 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms