Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNTD2Q8IXW0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNTD2Q8IXW0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms