Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERC6Q8IVU3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms