Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WDR49Q8IV35 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
WDR49Q8IV35 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms