Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF13Q86YI8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF13Q86YI8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms