Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
XIRP1Q702N8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XIRP1Q702N8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms