Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms