Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC129Q6ZRS4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC129Q6ZRS4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms